Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cbx4O55187 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cbx4O55187 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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