Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc3O55013 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms