Protein–RNA interactions for Protein: O54781

Srpk2, SRSF protein kinase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srpk2O54781 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Srpk2O54781 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Srpk2O54781 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Srpk2O54781 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Srpk2O54781 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Srpk2O54781 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Srpk2O54781 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Srpk2O54781 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Srpk2O54781 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms