Protein–RNA interactions for Protein: O35903

Ccl25, C-C motif chemokine 25, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl25O35903 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
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Ccl25O35903 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccl25O35903 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms