Protein–RNA interactions for Protein: O35714

Tnfrsf18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf18O35714 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf18O35714 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tnfrsf18O35714 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tnfrsf18O35714 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Tnfrsf18O35714 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf18O35714 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf18O35714 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf18O35714 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf18O35714 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf18O35714 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf18O35714 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf18O35714 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf18O35714 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf18O35714 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf18O35714 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf18O35714 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf18O35714 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf18O35714 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf18O35714 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf18O35714 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf18O35714 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf18O35714 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf18O35714 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf18O35714 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf18O35714 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf18O35714 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf18O35714 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf18O35714 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf18O35714 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf18O35714 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf18O35714 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfrsf18O35714 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms