Protein–RNA interactions for Protein: O35488

Slc27a2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a2O35488 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc27a2O35488 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc27a2O35488 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc27a2O35488 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc27a2O35488 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc27a2O35488 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc27a2O35488 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc27a2O35488 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc27a2O35488 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc27a2O35488 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc27a2O35488 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc27a2O35488 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc27a2O35488 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc27a2O35488 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc27a2O35488 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc27a2O35488 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc27a2O35488 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Slc27a2O35488 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc27a2O35488 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc27a2O35488 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Slc27a2O35488 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc27a2O35488 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc27a2O35488 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc27a2O35488 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc27a2O35488 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc27a2O35488 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc27a2O35488 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc27a2O35488 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc27a2O35488 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc27a2O35488 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc27a2O35488 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc27a2O35488 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc27a2O35488 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc27a2O35488 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc27a2O35488 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc27a2O35488 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc27a2O35488 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc27a2O35488 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc27a2O35488 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc27a2O35488 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc27a2O35488 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc27a2O35488 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc27a2O35488 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc27a2O35488 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc27a2O35488 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc27a2O35488 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc27a2O35488 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc27a2O35488 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc27a2O35488 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc27a2O35488 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc27a2O35488 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc27a2O35488 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc27a2O35488 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Slc27a2O35488 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc27a2O35488 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc27a2O35488 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc27a2O35488 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc27a2O35488 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc27a2O35488 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc27a2O35488 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc27a2O35488 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc27a2O35488 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc27a2O35488 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc27a2O35488 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc27a2O35488 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc27a2O35488 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc27a2O35488 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc27a2O35488 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc27a2O35488 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc27a2O35488 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc27a2O35488 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc27a2O35488 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc27a2O35488 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Slc27a2O35488 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Slc27a2O35488 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc27a2O35488 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc27a2O35488 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc27a2O35488 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc27a2O35488 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc27a2O35488 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc27a2O35488 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc27a2O35488 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc27a2O35488 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc27a2O35488 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc27a2O35488 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Slc27a2O35488 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc27a2O35488 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc27a2O35488 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc27a2O35488 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Slc27a2O35488 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc27a2O35488 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc27a2O35488 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc27a2O35488 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
Slc27a2O35488 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc27a2O35488 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc27a2O35488 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc27a2O35488 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc27a2O35488 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc27a2O35488 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc27a2O35488 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms