Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

Predictions only

Length 4,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
TnxbO35452 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
TnxbO35452 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
TnxbO35452 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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TnxbO35452 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
TnxbO35452 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TnxbO35452 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
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TnxbO35452 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
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TnxbO35452 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TnxbO35452 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TnxbO35452 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TnxbO35452 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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TnxbO35452 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TnxbO35452 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
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TnxbO35452 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
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TnxbO35452 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TnxbO35452 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms