Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Abcc1O35379 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms