Protein–RNA interactions for Protein: O35348

Colq, Acetylcholinesterase collagenic tail peptide, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ColqO35348 Gm9440-201ENSMUST00000119667 539 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ColqO35348 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ColqO35348 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ColqO35348 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ColqO35348 Gm28923-201ENSMUST00000187755 322 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ColqO35348 Gm37866-201ENSMUST00000191950 696 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ColqO35348 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ColqO35348 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ColqO35348 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ColqO35348 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ColqO35348 CT009713.1-201ENSMUST00000224828 853 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ColqO35348 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ColqO35348 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ColqO35348 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ColqO35348 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ColqO35348 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ColqO35348 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ColqO35348 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ColqO35348 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ColqO35348 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ColqO35348 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ColqO35348 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ColqO35348 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ColqO35348 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ColqO35348 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ColqO35348 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ColqO35348 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ColqO35348 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ColqO35348 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ColqO35348 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ColqO35348 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ColqO35348 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ColqO35348 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ColqO35348 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ColqO35348 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ColqO35348 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ColqO35348 4930532G15Rik-202ENSMUST00000195314 1457 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ColqO35348 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ColqO35348 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ColqO35348 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ColqO35348 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ColqO35348 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ColqO35348 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ColqO35348 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ColqO35348 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ColqO35348 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ColqO35348 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ColqO35348 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ColqO35348 Gm14301-201ENSMUST00000120181 324 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ColqO35348 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ColqO35348 Gm37751-201ENSMUST00000192440 1198 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ColqO35348 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ColqO35348 4930417O13Rik-204ENSMUST00000205000 999 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ColqO35348 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ColqO35348 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ColqO35348 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ColqO35348 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ColqO35348 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ColqO35348 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ColqO35348 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ColqO35348 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ColqO35348 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ColqO35348 Fopnl-202ENSMUST00000120707 1414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ColqO35348 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ColqO35348 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ColqO35348 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ColqO35348 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ColqO35348 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ColqO35348 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ColqO35348 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ColqO35348 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ColqO35348 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ColqO35348 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ColqO35348 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ColqO35348 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ColqO35348 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ColqO35348 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ColqO35348 Gm649-201ENSMUST00000117284 1054 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ColqO35348 Gm15074-201ENSMUST00000117603 936 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ColqO35348 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ColqO35348 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ColqO35348 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ColqO35348 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ColqO35348 2810404M03Rik-201ENSMUST00000188324 1245 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ColqO35348 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ColqO35348 4930568A13Rik-201ENSMUST00000199961 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ColqO35348 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ColqO35348 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ColqO35348 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ColqO35348 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ColqO35348 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ColqO35348 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ColqO35348 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ColqO35348 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ColqO35348 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ColqO35348 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ColqO35348 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ColqO35348 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ColqO35348 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ColqO35348 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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