Protein–RNA interactions for Protein: O35218

Cpsf2, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf2O35218 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpsf2O35218 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpsf2O35218 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpsf2O35218 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpsf2O35218 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpsf2O35218 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpsf2O35218 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpsf2O35218 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpsf2O35218 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpsf2O35218 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpsf2O35218 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpsf2O35218 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpsf2O35218 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpsf2O35218 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpsf2O35218 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpsf2O35218 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpsf2O35218 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpsf2O35218 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpsf2O35218 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpsf2O35218 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpsf2O35218 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpsf2O35218 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpsf2O35218 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpsf2O35218 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpsf2O35218 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpsf2O35218 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpsf2O35218 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpsf2O35218 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpsf2O35218 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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Cpsf2O35218 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpsf2O35218 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpsf2O35218 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpsf2O35218 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpsf2O35218 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpsf2O35218 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpsf2O35218 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpsf2O35218 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpsf2O35218 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpsf2O35218 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpsf2O35218 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpsf2O35218 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpsf2O35218 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpsf2O35218 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpsf2O35218 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpsf2O35218 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpsf2O35218 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpsf2O35218 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpsf2O35218 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpsf2O35218 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpsf2O35218 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpsf2O35218 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpsf2O35218 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpsf2O35218 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpsf2O35218 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpsf2O35218 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpsf2O35218 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpsf2O35218 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpsf2O35218 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpsf2O35218 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpsf2O35218 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpsf2O35218 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpsf2O35218 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpsf2O35218 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Cpsf2O35218 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpsf2O35218 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Cpsf2O35218 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpsf2O35218 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpsf2O35218 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpsf2O35218 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpsf2O35218 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpsf2O35218 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpsf2O35218 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpsf2O35218 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpsf2O35218 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpsf2O35218 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpsf2O35218 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpsf2O35218 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpsf2O35218 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpsf2O35218 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpsf2O35218 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpsf2O35218 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpsf2O35218 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpsf2O35218 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpsf2O35218 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpsf2O35218 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpsf2O35218 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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