Protein–RNA interactions for Protein: J3QNG1

Gm6408, Predicted gene 6408, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6408J3QNG1 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm6408J3QNG1 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6408J3QNG1 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6408J3QNG1 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6408J3QNG1 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6408J3QNG1 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6408J3QNG1 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6408J3QNG1 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6408J3QNG1 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6408J3QNG1 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6408J3QNG1 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6408J3QNG1 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6408J3QNG1 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6408J3QNG1 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6408J3QNG1 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6408J3QNG1 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6408J3QNG1 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6408J3QNG1 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6408J3QNG1 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6408J3QNG1 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6408J3QNG1 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6408J3QNG1 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6408J3QNG1 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6408J3QNG1 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6408J3QNG1 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm6408J3QNG1 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm6408J3QNG1 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm6408J3QNG1 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm6408J3QNG1 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm6408J3QNG1 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm6408J3QNG1 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm6408J3QNG1 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm6408J3QNG1 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm6408J3QNG1 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm6408J3QNG1 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm6408J3QNG1 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm6408J3QNG1 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm6408J3QNG1 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm6408J3QNG1 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm6408J3QNG1 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm6408J3QNG1 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm6408J3QNG1 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm6408J3QNG1 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm6408J3QNG1 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm6408J3QNG1 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm6408J3QNG1 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm6408J3QNG1 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm6408J3QNG1 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm6408J3QNG1 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm6408J3QNG1 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm6408J3QNG1 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm6408J3QNG1 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm6408J3QNG1 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm6408J3QNG1 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm6408J3QNG1 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm6408J3QNG1 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm6408J3QNG1 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm6408J3QNG1 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm6408J3QNG1 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm6408J3QNG1 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms