Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc180J3QNE4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc180J3QNE4 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc180J3QNE4 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc180J3QNE4 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc180J3QNE4 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc180J3QNE4 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc180J3QNE4 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc180J3QNE4 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc180J3QNE4 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc180J3QNE4 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc180J3QNE4 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc180J3QNE4 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc180J3QNE4 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc180J3QNE4 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc180J3QNE4 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc180J3QNE4 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc180J3QNE4 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc180J3QNE4 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc180J3QNE4 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc180J3QNE4 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc180J3QNE4 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc180J3QNE4 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc180J3QNE4 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc180J3QNE4 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc180J3QNE4 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc180J3QNE4 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc180J3QNE4 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms