Protein–RNA interactions for Protein: H7BX60

Pot1b, Protection of telomeres 1B, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pot1bH7BX60 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pot1bH7BX60 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pot1bH7BX60 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pot1bH7BX60 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pot1bH7BX60 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pot1bH7BX60 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pot1bH7BX60 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pot1bH7BX60 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pot1bH7BX60 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pot1bH7BX60 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pot1bH7BX60 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pot1bH7BX60 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pot1bH7BX60 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pot1bH7BX60 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pot1bH7BX60 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pot1bH7BX60 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pot1bH7BX60 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pot1bH7BX60 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pot1bH7BX60 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pot1bH7BX60 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pot1bH7BX60 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pot1bH7BX60 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pot1bH7BX60 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pot1bH7BX60 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pot1bH7BX60 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pot1bH7BX60 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pot1bH7BX60 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pot1bH7BX60 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pot1bH7BX60 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pot1bH7BX60 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pot1bH7BX60 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pot1bH7BX60 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pot1bH7BX60 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pot1bH7BX60 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pot1bH7BX60 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pot1bH7BX60 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pot1bH7BX60 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pot1bH7BX60 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pot1bH7BX60 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pot1bH7BX60 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pot1bH7BX60 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pot1bH7BX60 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pot1bH7BX60 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pot1bH7BX60 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pot1bH7BX60 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pot1bH7BX60 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pot1bH7BX60 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pot1bH7BX60 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pot1bH7BX60 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pot1bH7BX60 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pot1bH7BX60 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pot1bH7BX60 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pot1bH7BX60 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pot1bH7BX60 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pot1bH7BX60 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pot1bH7BX60 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pot1bH7BX60 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pot1bH7BX60 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pot1bH7BX60 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pot1bH7BX60 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pot1bH7BX60 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pot1bH7BX60 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pot1bH7BX60 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pot1bH7BX60 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pot1bH7BX60 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pot1bH7BX60 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pot1bH7BX60 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pot1bH7BX60 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pot1bH7BX60 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pot1bH7BX60 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pot1bH7BX60 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pot1bH7BX60 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pot1bH7BX60 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pot1bH7BX60 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pot1bH7BX60 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pot1bH7BX60 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pot1bH7BX60 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pot1bH7BX60 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pot1bH7BX60 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pot1bH7BX60 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pot1bH7BX60 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pot1bH7BX60 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pot1bH7BX60 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pot1bH7BX60 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pot1bH7BX60 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pot1bH7BX60 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pot1bH7BX60 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pot1bH7BX60 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pot1bH7BX60 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pot1bH7BX60 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pot1bH7BX60 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pot1bH7BX60 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pot1bH7BX60 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pot1bH7BX60 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pot1bH7BX60 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pot1bH7BX60 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pot1bH7BX60 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pot1bH7BX60 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pot1bH7BX60 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pot1bH7BX60 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms