Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Crocc2F6XLV1 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Crocc2F6XLV1 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Crocc2F6XLV1 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Crocc2F6XLV1 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Crocc2F6XLV1 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Crocc2F6XLV1 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Crocc2F6XLV1 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Crocc2F6XLV1 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Crocc2F6XLV1 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Crocc2F6XLV1 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Crocc2F6XLV1 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Crocc2F6XLV1 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Crocc2F6XLV1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Crocc2F6XLV1 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Crocc2F6XLV1 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Crocc2F6XLV1 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Crocc2F6XLV1 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Crocc2F6XLV1 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Crocc2F6XLV1 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Crocc2F6XLV1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Crocc2F6XLV1 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Crocc2F6XLV1 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Crocc2F6XLV1 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Crocc2F6XLV1 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Crocc2F6XLV1 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Crocc2F6XLV1 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Crocc2F6XLV1 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Crocc2F6XLV1 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Crocc2F6XLV1 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Crocc2F6XLV1 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Crocc2F6XLV1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Crocc2F6XLV1 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Crocc2F6XLV1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Crocc2F6XLV1 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Crocc2F6XLV1 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Crocc2F6XLV1 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Crocc2F6XLV1 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Crocc2F6XLV1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Crocc2F6XLV1 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Crocc2F6XLV1 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Crocc2F6XLV1 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Crocc2F6XLV1 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Crocc2F6XLV1 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Crocc2F6XLV1 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Crocc2F6XLV1 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Crocc2F6XLV1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Crocc2F6XLV1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Crocc2F6XLV1 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Crocc2F6XLV1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Crocc2F6XLV1 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Crocc2F6XLV1 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Crocc2F6XLV1 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Crocc2F6XLV1 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Crocc2F6XLV1 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Crocc2F6XLV1 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Crocc2F6XLV1 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Crocc2F6XLV1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Crocc2F6XLV1 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Crocc2F6XLV1 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Crocc2F6XLV1 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Crocc2F6XLV1 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Crocc2F6XLV1 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Crocc2F6XLV1 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Crocc2F6XLV1 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Crocc2F6XLV1 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Crocc2F6XLV1 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Crocc2F6XLV1 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Crocc2F6XLV1 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Crocc2F6XLV1 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Crocc2F6XLV1 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Crocc2F6XLV1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Crocc2F6XLV1 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Crocc2F6XLV1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Crocc2F6XLV1 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Crocc2F6XLV1 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Crocc2F6XLV1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Crocc2F6XLV1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Crocc2F6XLV1 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Crocc2F6XLV1 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Crocc2F6XLV1 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Crocc2F6XLV1 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Crocc2F6XLV1 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Crocc2F6XLV1 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Crocc2F6XLV1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Crocc2F6XLV1 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Crocc2F6XLV1 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Crocc2F6XLV1 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Crocc2F6XLV1 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Crocc2F6XLV1 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Crocc2F6XLV1 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Crocc2F6XLV1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Crocc2F6XLV1 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Crocc2F6XLV1 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Crocc2F6XLV1 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Crocc2F6XLV1 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Crocc2F6XLV1 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Crocc2F6XLV1 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Crocc2F6XLV1 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Crocc2F6XLV1 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms