Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmod3E9QA62 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms