Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7Q1

Gm5407, Predicted gene 5407, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5407E9Q7Q1 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm5407E9Q7Q1 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm5407E9Q7Q1 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Gm5407E9Q7Q1 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Gm5407E9Q7Q1 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Gm5407E9Q7Q1 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Gm5407E9Q7Q1 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Gm5407E9Q7Q1 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Gm5407E9Q7Q1 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Gm5407E9Q7Q1 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Gm5407E9Q7Q1 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Gm5407E9Q7Q1 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5407E9Q7Q1 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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