Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Urb2E9Q7L1 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Urb2E9Q7L1 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Urb2E9Q7L1 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Urb2E9Q7L1 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Urb2E9Q7L1 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Urb2E9Q7L1 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Urb2E9Q7L1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Urb2E9Q7L1 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Urb2E9Q7L1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Urb2E9Q7L1 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Urb2E9Q7L1 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Urb2E9Q7L1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Urb2E9Q7L1 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Urb2E9Q7L1 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Urb2E9Q7L1 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Urb2E9Q7L1 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Urb2E9Q7L1 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Urb2E9Q7L1 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Urb2E9Q7L1 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Urb2E9Q7L1 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Urb2E9Q7L1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Urb2E9Q7L1 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Urb2E9Q7L1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Urb2E9Q7L1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Urb2E9Q7L1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Urb2E9Q7L1 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Urb2E9Q7L1 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Urb2E9Q7L1 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Urb2E9Q7L1 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Urb2E9Q7L1 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Urb2E9Q7L1 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Urb2E9Q7L1 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Urb2E9Q7L1 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Urb2E9Q7L1 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Urb2E9Q7L1 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Urb2E9Q7L1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Urb2E9Q7L1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Urb2E9Q7L1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Urb2E9Q7L1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Urb2E9Q7L1 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Urb2E9Q7L1 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Urb2E9Q7L1 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Urb2E9Q7L1 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Urb2E9Q7L1 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Urb2E9Q7L1 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Urb2E9Q7L1 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Urb2E9Q7L1 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Urb2E9Q7L1 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Urb2E9Q7L1 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Urb2E9Q7L1 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Urb2E9Q7L1 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Urb2E9Q7L1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Urb2E9Q7L1 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Urb2E9Q7L1 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Urb2E9Q7L1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Urb2E9Q7L1 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Urb2E9Q7L1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Urb2E9Q7L1 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Urb2E9Q7L1 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Urb2E9Q7L1 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Urb2E9Q7L1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Urb2E9Q7L1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Urb2E9Q7L1 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Urb2E9Q7L1 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Urb2E9Q7L1 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Urb2E9Q7L1 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Urb2E9Q7L1 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Urb2E9Q7L1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Urb2E9Q7L1 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Urb2E9Q7L1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Urb2E9Q7L1 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Urb2E9Q7L1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Urb2E9Q7L1 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Urb2E9Q7L1 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms