Protein–RNA interactions for Protein: E9Q492

Pgbd1, PiggyBac transposable element-derived 1, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgbd1E9Q492 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pgbd1E9Q492 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pgbd1E9Q492 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pgbd1E9Q492 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pgbd1E9Q492 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pgbd1E9Q492 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pgbd1E9Q492 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pgbd1E9Q492 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pgbd1E9Q492 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pgbd1E9Q492 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pgbd1E9Q492 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Pgbd1E9Q492 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pgbd1E9Q492 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pgbd1E9Q492 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pgbd1E9Q492 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pgbd1E9Q492 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pgbd1E9Q492 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pgbd1E9Q492 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pgbd1E9Q492 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Pgbd1E9Q492 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pgbd1E9Q492 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pgbd1E9Q492 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pgbd1E9Q492 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pgbd1E9Q492 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pgbd1E9Q492 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pgbd1E9Q492 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pgbd1E9Q492 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pgbd1E9Q492 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pgbd1E9Q492 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pgbd1E9Q492 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pgbd1E9Q492 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pgbd1E9Q492 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pgbd1E9Q492 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pgbd1E9Q492 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pgbd1E9Q492 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pgbd1E9Q492 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pgbd1E9Q492 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pgbd1E9Q492 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pgbd1E9Q492 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pgbd1E9Q492 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pgbd1E9Q492 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pgbd1E9Q492 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pgbd1E9Q492 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pgbd1E9Q492 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pgbd1E9Q492 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pgbd1E9Q492 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pgbd1E9Q492 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pgbd1E9Q492 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pgbd1E9Q492 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pgbd1E9Q492 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pgbd1E9Q492 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pgbd1E9Q492 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pgbd1E9Q492 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pgbd1E9Q492 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pgbd1E9Q492 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pgbd1E9Q492 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pgbd1E9Q492 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pgbd1E9Q492 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pgbd1E9Q492 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pgbd1E9Q492 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pgbd1E9Q492 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pgbd1E9Q492 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pgbd1E9Q492 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pgbd1E9Q492 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pgbd1E9Q492 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pgbd1E9Q492 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pgbd1E9Q492 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pgbd1E9Q492 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Pgbd1E9Q492 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pgbd1E9Q492 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pgbd1E9Q492 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pgbd1E9Q492 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pgbd1E9Q492 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pgbd1E9Q492 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pgbd1E9Q492 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pgbd1E9Q492 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pgbd1E9Q492 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pgbd1E9Q492 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pgbd1E9Q492 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pgbd1E9Q492 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pgbd1E9Q492 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pgbd1E9Q492 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pgbd1E9Q492 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pgbd1E9Q492 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pgbd1E9Q492 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pgbd1E9Q492 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pgbd1E9Q492 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pgbd1E9Q492 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pgbd1E9Q492 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pgbd1E9Q492 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pgbd1E9Q492 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pgbd1E9Q492 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pgbd1E9Q492 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pgbd1E9Q492 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pgbd1E9Q492 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pgbd1E9Q492 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pgbd1E9Q492 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.7 ms