Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2E4

Hectd4, HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 4, mousemouse

Predictions only

Length 4,418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hectd4E9Q2E4 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Hectd4E9Q2E4 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Hectd4E9Q2E4 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Hectd4E9Q2E4 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Hectd4E9Q2E4 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Hectd4E9Q2E4 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Hectd4E9Q2E4 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Hectd4E9Q2E4 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Hectd4E9Q2E4 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Hectd4E9Q2E4 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Hectd4E9Q2E4 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Hectd4E9Q2E4 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Hectd4E9Q2E4 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Hectd4E9Q2E4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Hectd4E9Q2E4 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Hectd4E9Q2E4 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Hectd4E9Q2E4 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Hectd4E9Q2E4 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Hectd4E9Q2E4 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Hectd4E9Q2E4 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Hectd4E9Q2E4 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Hectd4E9Q2E4 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Hectd4E9Q2E4 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Hectd4E9Q2E4 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Hectd4E9Q2E4 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Hectd4E9Q2E4 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Hectd4E9Q2E4 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Hectd4E9Q2E4 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Hectd4E9Q2E4 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Hectd4E9Q2E4 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Hectd4E9Q2E4 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Hectd4E9Q2E4 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Hectd4E9Q2E4 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Hectd4E9Q2E4 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Hectd4E9Q2E4 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Hectd4E9Q2E4 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Hectd4E9Q2E4 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Hectd4E9Q2E4 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Hectd4E9Q2E4 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Hectd4E9Q2E4 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Hectd4E9Q2E4 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Hectd4E9Q2E4 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Hectd4E9Q2E4 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Hectd4E9Q2E4 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Hectd4E9Q2E4 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Hectd4E9Q2E4 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Hectd4E9Q2E4 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Hectd4E9Q2E4 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Hectd4E9Q2E4 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Hectd4E9Q2E4 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Hectd4E9Q2E4 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Hectd4E9Q2E4 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Hectd4E9Q2E4 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Hectd4E9Q2E4 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Hectd4E9Q2E4 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Hectd4E9Q2E4 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Hectd4E9Q2E4 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Hectd4E9Q2E4 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Hectd4E9Q2E4 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Hectd4E9Q2E4 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
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Hectd4E9Q2E4 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Hectd4E9Q2E4 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Hectd4E9Q2E4 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
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Hectd4E9Q2E4 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
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Hectd4E9Q2E4 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Hectd4E9Q2E4 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Hectd4E9Q2E4 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Hectd4E9Q2E4 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Hectd4E9Q2E4 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Hectd4E9Q2E4 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Hectd4E9Q2E4 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Hectd4E9Q2E4 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Hectd4E9Q2E4 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Hectd4E9Q2E4 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Hectd4E9Q2E4 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Hectd4E9Q2E4 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Hectd4E9Q2E4 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Hectd4E9Q2E4 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Hectd4E9Q2E4 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Hectd4E9Q2E4 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Hectd4E9Q2E4 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Hectd4E9Q2E4 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Hectd4E9Q2E4 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Hectd4E9Q2E4 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Hectd4E9Q2E4 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Hectd4E9Q2E4 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Hectd4E9Q2E4 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Hectd4E9Q2E4 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Hectd4E9Q2E4 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Hectd4E9Q2E4 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Hectd4E9Q2E4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Hectd4E9Q2E4 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Hectd4E9Q2E4 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Hectd4E9Q2E4 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
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