Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Pdzd2E9Q1M1 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pdzd2E9Q1M1 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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