Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt78E9Q0F0 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms