Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm20425E9Q035 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm20425E9Q035 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm20425E9Q035 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm20425E9Q035 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm20425E9Q035 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm20425E9Q035 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms