Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syde2E9PUP1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syde2E9PUP1 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms