Protein–RNA interactions for Protein: E0CXS8

Gm8113, Predicted gene 8113, mousemouse

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Length 587 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8113E0CXS8 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8113E0CXS8 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8113E0CXS8 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8113E0CXS8 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8113E0CXS8 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8113E0CXS8 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8113E0CXS8 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8113E0CXS8 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Gm8113E0CXS8 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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Gm8113E0CXS8 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Gm8113E0CXS8 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8113E0CXS8 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8113E0CXS8 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8113E0CXS8 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8113E0CXS8 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8113E0CXS8 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8113E0CXS8 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8113E0CXS8 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8113E0CXS8 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8113E0CXS8 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Gm8113E0CXS8 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm8113E0CXS8 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Gm8113E0CXS8 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8113E0CXS8 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8113E0CXS8 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8113E0CXS8 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8113E0CXS8 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Gm8113E0CXS8 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8113E0CXS8 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm8113E0CXS8 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Gm8113E0CXS8 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Gm8113E0CXS8 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8113E0CXS8 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Gm8113E0CXS8 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8113E0CXS8 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8113E0CXS8 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8113E0CXS8 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Gm8113E0CXS8 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8113E0CXS8 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8113E0CXS8 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8113E0CXS8 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8113E0CXS8 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8113E0CXS8 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8113E0CXS8 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8113E0CXS8 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm8113E0CXS8 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8113E0CXS8 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8113E0CXS8 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8113E0CXS8 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8113E0CXS8 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms