Protein–RNA interactions for Protein: D3YZZ2

Tgfbr3l, Transforming growth factor, beta receptor III-like, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfbr3lD3YZZ2 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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