Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc6D3YZP9 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc6D3YZP9 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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