Protein–RNA interactions for Protein: D3YU81

Rfx8, DNA-binding protein RFX8, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx8D3YU81 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Rfx8D3YU81 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Rfx8D3YU81 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rfx8D3YU81 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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