Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Clip3B9EHT4 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Clip3B9EHT4 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Clip3B9EHT4 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Clip3B9EHT4 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
Clip3B9EHT4 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Clip3B9EHT4 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Clip3B9EHT4 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Clip3B9EHT4 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Clip3B9EHT4 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Clip3B9EHT4 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Clip3B9EHT4 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Clip3B9EHT4 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Clip3B9EHT4 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Clip3B9EHT4 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Clip3B9EHT4 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Clip3B9EHT4 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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