Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cspp1B2RX88 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms