Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brpf3B2KF05 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms