Protein–RNA interactions for Protein: B1ARV6

Pramef20, PRAME family member 20, mousemouse

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Length 477 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef20B1ARV6 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pramef20B1ARV6 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pramef20B1ARV6 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pramef20B1ARV6 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Pramef20B1ARV6 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Pramef20B1ARV6 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pramef20B1ARV6 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms