Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M5A7VMS3 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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