Protein–RNA interactions for Protein: A4UUI3

Gbp4, Guanylate binding protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4A4UUI3 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp4A4UUI3 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp4A4UUI3 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp4A4UUI3 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp4A4UUI3 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp4A4UUI3 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp4A4UUI3 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp4A4UUI3 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp4A4UUI3 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gbp4A4UUI3 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp4A4UUI3 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp4A4UUI3 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp4A4UUI3 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp4A4UUI3 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp4A4UUI3 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gbp4A4UUI3 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gbp4A4UUI3 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gbp4A4UUI3 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp4A4UUI3 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp4A4UUI3 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp4A4UUI3 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp4A4UUI3 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp4A4UUI3 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp4A4UUI3 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp4A4UUI3 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp4A4UUI3 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp4A4UUI3 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp4A4UUI3 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp4A4UUI3 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp4A4UUI3 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp4A4UUI3 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbp4A4UUI3 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbp4A4UUI3 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbp4A4UUI3 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbp4A4UUI3 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbp4A4UUI3 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbp4A4UUI3 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbp4A4UUI3 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gbp4A4UUI3 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gbp4A4UUI3 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gbp4A4UUI3 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gbp4A4UUI3 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbp4A4UUI3 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbp4A4UUI3 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbp4A4UUI3 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbp4A4UUI3 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gbp4A4UUI3 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gbp4A4UUI3 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbp4A4UUI3 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbp4A4UUI3 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbp4A4UUI3 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbp4A4UUI3 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbp4A4UUI3 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbp4A4UUI3 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gbp4A4UUI3 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gbp4A4UUI3 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gbp4A4UUI3 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gbp4A4UUI3 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gbp4A4UUI3 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gbp4A4UUI3 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gbp4A4UUI3 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Gbp4A4UUI3 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gbp4A4UUI3 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gbp4A4UUI3 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gbp4A4UUI3 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gbp4A4UUI3 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gbp4A4UUI3 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gbp4A4UUI3 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gbp4A4UUI3 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Gbp4A4UUI3 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gbp4A4UUI3 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gbp4A4UUI3 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gbp4A4UUI3 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gbp4A4UUI3 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gbp4A4UUI3 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gbp4A4UUI3 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.1 ms