Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9F4

Ttll11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll11A4Q9F4 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll11A4Q9F4 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll11A4Q9F4 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll11A4Q9F4 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll11A4Q9F4 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll11A4Q9F4 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll11A4Q9F4 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll11A4Q9F4 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll11A4Q9F4 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll11A4Q9F4 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll11A4Q9F4 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ttll11A4Q9F4 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll11A4Q9F4 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll11A4Q9F4 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll11A4Q9F4 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll11A4Q9F4 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll11A4Q9F4 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll11A4Q9F4 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll11A4Q9F4 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll11A4Q9F4 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ttll11A4Q9F4 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ttll11A4Q9F4 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll11A4Q9F4 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ttll11A4Q9F4 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll11A4Q9F4 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll11A4Q9F4 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll11A4Q9F4 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ttll11A4Q9F4 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll11A4Q9F4 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll11A4Q9F4 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll11A4Q9F4 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll11A4Q9F4 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll11A4Q9F4 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll11A4Q9F4 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll11A4Q9F4 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll11A4Q9F4 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttll11A4Q9F4 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ttll11A4Q9F4 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ttll11A4Q9F4 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ttll11A4Q9F4 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ttll11A4Q9F4 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ttll11A4Q9F4 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ttll11A4Q9F4 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ttll11A4Q9F4 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ttll11A4Q9F4 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ttll11A4Q9F4 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttll11A4Q9F4 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttll11A4Q9F4 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttll11A4Q9F4 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ttll11A4Q9F4 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ttll11A4Q9F4 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ttll11A4Q9F4 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttll11A4Q9F4 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ttll11A4Q9F4 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ttll11A4Q9F4 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ttll11A4Q9F4 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ttll11A4Q9F4 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttll11A4Q9F4 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttll11A4Q9F4 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttll11A4Q9F4 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttll11A4Q9F4 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttll11A4Q9F4 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttll11A4Q9F4 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttll11A4Q9F4 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttll11A4Q9F4 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttll11A4Q9F4 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttll11A4Q9F4 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttll11A4Q9F4 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ttll11A4Q9F4 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttll11A4Q9F4 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ttll11A4Q9F4 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttll11A4Q9F4 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttll11A4Q9F4 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttll11A4Q9F4 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttll11A4Q9F4 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttll11A4Q9F4 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttll11A4Q9F4 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttll11A4Q9F4 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttll11A4Q9F4 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttll11A4Q9F4 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttll11A4Q9F4 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ttll11A4Q9F4 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ttll11A4Q9F4 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ttll11A4Q9F4 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ttll11A4Q9F4 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttll11A4Q9F4 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttll11A4Q9F4 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttll11A4Q9F4 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ttll11A4Q9F4 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttll11A4Q9F4 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttll11A4Q9F4 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttll11A4Q9F4 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttll11A4Q9F4 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttll11A4Q9F4 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ttll11A4Q9F4 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttll11A4Q9F4 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttll11A4Q9F4 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ttll11A4Q9F4 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ttll11A4Q9F4 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttll11A4Q9F4 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms