Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Odf2A3KGV1 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms