Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Samt1A2BED8 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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