Protein–RNA interactions for Protein: A2AM80

Fam43b, Family with sequence similarity 43, member B, mousemouse

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Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam43bA2AM80 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam43bA2AM80 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam43bA2AM80 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam43bA2AM80 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam43bA2AM80 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam43bA2AM80 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam43bA2AM80 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam43bA2AM80 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam43bA2AM80 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam43bA2AM80 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam43bA2AM80 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam43bA2AM80 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam43bA2AM80 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam43bA2AM80 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam43bA2AM80 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam43bA2AM80 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam43bA2AM80 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam43bA2AM80 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam43bA2AM80 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam43bA2AM80 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam43bA2AM80 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam43bA2AM80 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam43bA2AM80 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam43bA2AM80 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam43bA2AM80 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam43bA2AM80 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam43bA2AM80 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam43bA2AM80 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam43bA2AM80 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam43bA2AM80 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam43bA2AM80 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam43bA2AM80 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam43bA2AM80 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam43bA2AM80 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam43bA2AM80 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam43bA2AM80 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam43bA2AM80 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam43bA2AM80 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam43bA2AM80 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam43bA2AM80 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam43bA2AM80 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam43bA2AM80 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam43bA2AM80 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam43bA2AM80 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam43bA2AM80 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam43bA2AM80 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam43bA2AM80 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam43bA2AM80 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam43bA2AM80 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam43bA2AM80 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam43bA2AM80 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam43bA2AM80 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam43bA2AM80 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam43bA2AM80 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam43bA2AM80 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam43bA2AM80 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam43bA2AM80 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam43bA2AM80 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam43bA2AM80 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam43bA2AM80 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam43bA2AM80 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam43bA2AM80 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Fam43bA2AM80 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam43bA2AM80 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam43bA2AM80 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms