Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Col9a3A2ACT7 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Col9a3A2ACT7 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Col9a3A2ACT7 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Col9a3A2ACT7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Col9a3A2ACT7 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Col9a3A2ACT7 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Col9a3A2ACT7 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Col9a3A2ACT7 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Col9a3A2ACT7 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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