Protein–RNA interactions for Protein: A2ACP1

Ttc39a, Tetratricopeptide repeat protein 39A, mousemouse

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Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39aA2ACP1 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc39aA2ACP1 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc39aA2ACP1 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc39aA2ACP1 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc39aA2ACP1 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc39aA2ACP1 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc39aA2ACP1 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc39aA2ACP1 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc39aA2ACP1 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc39aA2ACP1 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc39aA2ACP1 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc39aA2ACP1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc39aA2ACP1 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc39aA2ACP1 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc39aA2ACP1 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc39aA2ACP1 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc39aA2ACP1 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc39aA2ACP1 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc39aA2ACP1 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc39aA2ACP1 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc39aA2ACP1 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc39aA2ACP1 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc39aA2ACP1 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc39aA2ACP1 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc39aA2ACP1 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc39aA2ACP1 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc39aA2ACP1 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ttc39aA2ACP1 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ttc39aA2ACP1 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ttc39aA2ACP1 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ttc39aA2ACP1 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ttc39aA2ACP1 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ttc39aA2ACP1 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ttc39aA2ACP1 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ttc39aA2ACP1 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc39aA2ACP1 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc39aA2ACP1 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc39aA2ACP1 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc39aA2ACP1 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc39aA2ACP1 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc39aA2ACP1 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc39aA2ACP1 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc39aA2ACP1 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc39aA2ACP1 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc39aA2ACP1 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc39aA2ACP1 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc39aA2ACP1 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc39aA2ACP1 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc39aA2ACP1 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc39aA2ACP1 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc39aA2ACP1 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc39aA2ACP1 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc39aA2ACP1 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc39aA2ACP1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc39aA2ACP1 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc39aA2ACP1 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc39aA2ACP1 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc39aA2ACP1 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc39aA2ACP1 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc39aA2ACP1 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc39aA2ACP1 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc39aA2ACP1 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc39aA2ACP1 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc39aA2ACP1 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc39aA2ACP1 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc39aA2ACP1 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc39aA2ACP1 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc39aA2ACP1 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc39aA2ACP1 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc39aA2ACP1 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc39aA2ACP1 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc39aA2ACP1 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc39aA2ACP1 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc39aA2ACP1 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc39aA2ACP1 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc39aA2ACP1 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc39aA2ACP1 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc39aA2ACP1 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc39aA2ACP1 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc39aA2ACP1 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc39aA2ACP1 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc39aA2ACP1 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc39aA2ACP1 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc39aA2ACP1 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc39aA2ACP1 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc39aA2ACP1 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc39aA2ACP1 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc39aA2ACP1 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc39aA2ACP1 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc39aA2ACP1 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc39aA2ACP1 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc39aA2ACP1 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc39aA2ACP1 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc39aA2ACP1 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc39aA2ACP1 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc39aA2ACP1 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc39aA2ACP1 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc39aA2ACP1 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc39aA2ACP1 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ttc39aA2ACP1 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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