Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Speer3W4VSP1 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Speer3W4VSP1 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Speer3W4VSP1 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Speer3W4VSP1 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Speer3W4VSP1 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Speer3W4VSP1 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Speer3W4VSP1 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Speer3W4VSP1 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Speer3W4VSP1 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Speer3W4VSP1 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Speer3W4VSP1 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Speer3W4VSP1 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Speer3W4VSP1 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Speer3W4VSP1 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Speer3W4VSP1 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Speer3W4VSP1 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Speer3W4VSP1 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Speer3W4VSP1 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Speer3W4VSP1 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Speer3W4VSP1 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Speer3W4VSP1 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Speer3W4VSP1 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Speer3W4VSP1 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Speer3W4VSP1 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Speer3W4VSP1 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Speer3W4VSP1 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Speer3W4VSP1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Speer3W4VSP1 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Speer3W4VSP1 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Speer3W4VSP1 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Speer3W4VSP1 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Speer3W4VSP1 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Speer3W4VSP1 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Speer3W4VSP1 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Speer3W4VSP1 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Speer3W4VSP1 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Speer3W4VSP1 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Speer3W4VSP1 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Speer3W4VSP1 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Speer3W4VSP1 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Speer3W4VSP1 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Speer3W4VSP1 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Speer3W4VSP1 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Speer3W4VSP1 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Speer3W4VSP1 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Speer3W4VSP1 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Speer3W4VSP1 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Speer3W4VSP1 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Speer3W4VSP1 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Speer3W4VSP1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Speer3W4VSP1 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Speer3W4VSP1 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Speer3W4VSP1 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Speer3W4VSP1 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Speer3W4VSP1 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Speer3W4VSP1 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Speer3W4VSP1 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Speer3W4VSP1 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Speer3W4VSP1 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Speer3W4VSP1 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Speer3W4VSP1 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Speer3W4VSP1 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Speer3W4VSP1 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Speer3W4VSP1 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Speer3W4VSP1 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Speer3W4VSP1 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Speer3W4VSP1 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Speer3W4VSP1 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Speer3W4VSP1 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Speer3W4VSP1 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Speer3W4VSP1 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Speer3W4VSP1 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Speer3W4VSP1 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Speer3W4VSP1 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Speer3W4VSP1 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Speer3W4VSP1 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Speer3W4VSP1 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Speer3W4VSP1 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Speer3W4VSP1 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Speer3W4VSP1 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Speer3W4VSP1 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Speer3W4VSP1 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Speer3W4VSP1 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Speer3W4VSP1 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Speer3W4VSP1 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Speer3W4VSP1 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Speer3W4VSP1 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Speer3W4VSP1 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Speer3W4VSP1 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Speer3W4VSP1 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Speer3W4VSP1 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Speer3W4VSP1 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Speer3W4VSP1 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Speer3W4VSP1 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Speer3W4VSP1 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Speer3W4VSP1 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Speer3W4VSP1 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Speer3W4VSP1 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Speer3W4VSP1 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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