Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm3550W4VSN7 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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