Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt27Q9Z320 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt27Q9Z320 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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