Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Homer1Q9Z2Y3 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Homer1Q9Z2Y3 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Homer1Q9Z2Y3 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Homer1Q9Z2Y3 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Homer1Q9Z2Y3 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Homer1Q9Z2Y3 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Homer1Q9Z2Y3 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Homer1Q9Z2Y3 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Homer1Q9Z2Y3 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Homer1Q9Z2Y3 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Homer1Q9Z2Y3 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Homer1Q9Z2Y3 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Homer1Q9Z2Y3 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Homer1Q9Z2Y3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Homer1Q9Z2Y3 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Homer1Q9Z2Y3 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Homer1Q9Z2Y3 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Homer1Q9Z2Y3 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Homer1Q9Z2Y3 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Homer1Q9Z2Y3 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Homer1Q9Z2Y3 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms