Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms