Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms