Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z238

Ccne2, G1/S-specific cyclin-E2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne2Q9Z238 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccne2Q9Z238 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.8 ms