Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ilf3Q9Z1X4 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ilf3Q9Z1X4 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ilf3Q9Z1X4 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ilf3Q9Z1X4 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ilf3Q9Z1X4 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ilf3Q9Z1X4 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ilf3Q9Z1X4 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ilf3Q9Z1X4 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ilf3Q9Z1X4 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ilf3Q9Z1X4 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ilf3Q9Z1X4 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ilf3Q9Z1X4 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ilf3Q9Z1X4 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ilf3Q9Z1X4 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ilf3Q9Z1X4 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ilf3Q9Z1X4 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ilf3Q9Z1X4 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ilf3Q9Z1X4 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ilf3Q9Z1X4 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ilf3Q9Z1X4 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ilf3Q9Z1X4 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ilf3Q9Z1X4 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ilf3Q9Z1X4 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ilf3Q9Z1X4 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ilf3Q9Z1X4 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ilf3Q9Z1X4 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ilf3Q9Z1X4 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ilf3Q9Z1X4 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ilf3Q9Z1X4 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ilf3Q9Z1X4 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ilf3Q9Z1X4 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ilf3Q9Z1X4 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ilf3Q9Z1X4 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ilf3Q9Z1X4 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ilf3Q9Z1X4 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ilf3Q9Z1X4 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ilf3Q9Z1X4 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Ilf3Q9Z1X4 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ilf3Q9Z1X4 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ilf3Q9Z1X4 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ilf3Q9Z1X4 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ilf3Q9Z1X4 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ilf3Q9Z1X4 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ilf3Q9Z1X4 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ilf3Q9Z1X4 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ilf3Q9Z1X4 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ilf3Q9Z1X4 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ilf3Q9Z1X4 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ilf3Q9Z1X4 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ilf3Q9Z1X4 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ilf3Q9Z1X4 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ilf3Q9Z1X4 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ilf3Q9Z1X4 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ilf3Q9Z1X4 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ilf3Q9Z1X4 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ilf3Q9Z1X4 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ilf3Q9Z1X4 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ilf3Q9Z1X4 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ilf3Q9Z1X4 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ilf3Q9Z1X4 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ilf3Q9Z1X4 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ilf3Q9Z1X4 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ilf3Q9Z1X4 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms