Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z131

Sh3bp5, SH3 domain-binding protein 5, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Sh3bp5Q9Z131 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh3bp5Q9Z131 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh3bp5Q9Z131 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Sh3bp5Q9Z131 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Sh3bp5Q9Z131 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp5Q9Z131 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp5Q9Z131 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp5Q9Z131 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp5Q9Z131 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp5Q9Z131 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp5Q9Z131 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp5Q9Z131 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp5Q9Z131 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp5Q9Z131 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp5Q9Z131 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms