Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W3

Nup160, Nuclear pore complex protein Nup160, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup160Q9Z0W3 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Nup160Q9Z0W3 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nup160Q9Z0W3 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Nup160Q9Z0W3 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nup160Q9Z0W3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nup160Q9Z0W3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nup160Q9Z0W3 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nup160Q9Z0W3 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nup160Q9Z0W3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nup160Q9Z0W3 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nup160Q9Z0W3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nup160Q9Z0W3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nup160Q9Z0W3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nup160Q9Z0W3 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nup160Q9Z0W3 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nup160Q9Z0W3 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Nup160Q9Z0W3 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nup160Q9Z0W3 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Nup160Q9Z0W3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nup160Q9Z0W3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nup160Q9Z0W3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nup160Q9Z0W3 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nup160Q9Z0W3 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nup160Q9Z0W3 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nup160Q9Z0W3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nup160Q9Z0W3 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nup160Q9Z0W3 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nup160Q9Z0W3 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nup160Q9Z0W3 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nup160Q9Z0W3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nup160Q9Z0W3 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nup160Q9Z0W3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nup160Q9Z0W3 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nup160Q9Z0W3 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nup160Q9Z0W3 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nup160Q9Z0W3 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nup160Q9Z0W3 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nup160Q9Z0W3 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Nup160Q9Z0W3 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nup160Q9Z0W3 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Nup160Q9Z0W3 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nup160Q9Z0W3 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nup160Q9Z0W3 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Nup160Q9Z0W3 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Nup160Q9Z0W3 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nup160Q9Z0W3 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nup160Q9Z0W3 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Nup160Q9Z0W3 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nup160Q9Z0W3 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nup160Q9Z0W3 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nup160Q9Z0W3 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nup160Q9Z0W3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nup160Q9Z0W3 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nup160Q9Z0W3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nup160Q9Z0W3 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nup160Q9Z0W3 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nup160Q9Z0W3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nup160Q9Z0W3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nup160Q9Z0W3 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nup160Q9Z0W3 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Nup160Q9Z0W3 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nup160Q9Z0W3 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nup160Q9Z0W3 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nup160Q9Z0W3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nup160Q9Z0W3 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nup160Q9Z0W3 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nup160Q9Z0W3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nup160Q9Z0W3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nup160Q9Z0W3 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nup160Q9Z0W3 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nup160Q9Z0W3 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nup160Q9Z0W3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nup160Q9Z0W3 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Nup160Q9Z0W3 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Nup160Q9Z0W3 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Nup160Q9Z0W3 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nup160Q9Z0W3 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nup160Q9Z0W3 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nup160Q9Z0W3 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Nup160Q9Z0W3 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Nup160Q9Z0W3 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nup160Q9Z0W3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nup160Q9Z0W3 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nup160Q9Z0W3 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nup160Q9Z0W3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nup160Q9Z0W3 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nup160Q9Z0W3 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nup160Q9Z0W3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Nup160Q9Z0W3 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nup160Q9Z0W3 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nup160Q9Z0W3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nup160Q9Z0W3 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nup160Q9Z0W3 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Nup160Q9Z0W3 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Nup160Q9Z0W3 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Nup160Q9Z0W3 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Nup160Q9Z0W3 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Nup160Q9Z0W3 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nup160Q9Z0W3 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nup160Q9Z0W3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms