Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVP6

Papolb, Poly(A) polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PapolbQ9WVP6 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PapolbQ9WVP6 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PapolbQ9WVP6 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PapolbQ9WVP6 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PapolbQ9WVP6 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PapolbQ9WVP6 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PapolbQ9WVP6 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PapolbQ9WVP6 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PapolbQ9WVP6 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PapolbQ9WVP6 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PapolbQ9WVP6 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PapolbQ9WVP6 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PapolbQ9WVP6 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PapolbQ9WVP6 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PapolbQ9WVP6 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PapolbQ9WVP6 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PapolbQ9WVP6 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PapolbQ9WVP6 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PapolbQ9WVP6 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PapolbQ9WVP6 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PapolbQ9WVP6 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PapolbQ9WVP6 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PapolbQ9WVP6 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PapolbQ9WVP6 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PapolbQ9WVP6 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PapolbQ9WVP6 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PapolbQ9WVP6 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PapolbQ9WVP6 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PapolbQ9WVP6 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PapolbQ9WVP6 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PapolbQ9WVP6 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PapolbQ9WVP6 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PapolbQ9WVP6 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PapolbQ9WVP6 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PapolbQ9WVP6 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PapolbQ9WVP6 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PapolbQ9WVP6 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PapolbQ9WVP6 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PapolbQ9WVP6 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PapolbQ9WVP6 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PapolbQ9WVP6 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PapolbQ9WVP6 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PapolbQ9WVP6 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PapolbQ9WVP6 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PapolbQ9WVP6 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PapolbQ9WVP6 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PapolbQ9WVP6 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PapolbQ9WVP6 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PapolbQ9WVP6 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PapolbQ9WVP6 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PapolbQ9WVP6 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PapolbQ9WVP6 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PapolbQ9WVP6 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PapolbQ9WVP6 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PapolbQ9WVP6 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PapolbQ9WVP6 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PapolbQ9WVP6 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PapolbQ9WVP6 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PapolbQ9WVP6 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PapolbQ9WVP6 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PapolbQ9WVP6 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PapolbQ9WVP6 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PapolbQ9WVP6 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PapolbQ9WVP6 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PapolbQ9WVP6 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PapolbQ9WVP6 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PapolbQ9WVP6 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PapolbQ9WVP6 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PapolbQ9WVP6 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PapolbQ9WVP6 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PapolbQ9WVP6 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PapolbQ9WVP6 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PapolbQ9WVP6 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PapolbQ9WVP6 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PapolbQ9WVP6 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PapolbQ9WVP6 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PapolbQ9WVP6 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PapolbQ9WVP6 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PapolbQ9WVP6 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PapolbQ9WVP6 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PapolbQ9WVP6 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PapolbQ9WVP6 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PapolbQ9WVP6 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PapolbQ9WVP6 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PapolbQ9WVP6 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PapolbQ9WVP6 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PapolbQ9WVP6 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PapolbQ9WVP6 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PapolbQ9WVP6 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PapolbQ9WVP6 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PapolbQ9WVP6 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PapolbQ9WVP6 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PapolbQ9WVP6 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PapolbQ9WVP6 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PapolbQ9WVP6 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PapolbQ9WVP6 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PapolbQ9WVP6 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PapolbQ9WVP6 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PapolbQ9WVP6 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PapolbQ9WVP6 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms